Princip izolatora od kaljenog stakla

Neki pojačivači nalaze se uzvodno od promotora, dok su drugi nizvodno, tako da učinak izolatora ne ovisi o njegovom relativnom položaju u odnosu na promotor. Stoga razlog za usmjerenost učinka izolatora još nije u potpunosti razjašnjen. Trenutno je otkriveno da dva lokusa utječu na funkciju izolatora putem trans-aktivacije. Gen S2J(Hw) kodira nukleoprotein koji prepoznaje izolatore; izolator svoj izolacijski učinak ispoljava tek nakon što se na njega veže. Kada ovaj gen mutira, iako je izolator umetnut u y lokus, učinak izolacije se gubi i y se izražava u svim tkivima. Drugi lokus je mod(mdg 4), a mutacije u ovom genu imaju suprotan učinak od Su(Hw); svi ovi mutanti pojačavaju izolacijski učinak, čineći izolacijski učinak izolatora više ne usmjerenim nego proširenim, blokirajući tako učinke uzvodnih i nizvodnih pojačivača. Jedno od objašnjenja je da se Su(Hw) prvo veže na izolator DNA, dajući izolatoru njegov izolacijski učinak. Kada se mod(mdg4) kombinira sa Su(Hw), izolator gubi svoj izolacijski učinak; kada se mod(mdg4) naglo promijeni, ne može se kombinirati sa Su(Hw), stoga se izolacijski učinak izolatora ponovno pojačava.